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La génomique, “pas aussi fiable que le testage sur descendance” / Select Sires (USA) continuera à tester 320 taureaux par an
 

Je me réjouis d'apprendre que certains pays concurrents en matière de génétique bovine s'apprêtent à abandonner le testage des jeunes taureaux", déclare Charlie Will, responsable génétique du plus grand programme de sélection aux États-Unis. Ses 35 ans de carrière et la réussite d'un programme qui a conçu d'illustres géniteurs tels qu' Élévation, Bell, Valiant, Blackstar ou plus récemment Shottle et Million, donnent du poids au propos. Les index génomiques des jeunes taureaux ne sont-ils pas fiables ? "Si, mais ils ne valent toujours pas les index calculés après testage des filles", répond Charlie Will. Select Sires poursuivra donc son programme de testage.


250 dollars le test génomique


"La sélection sur ascendance est toujours inéluctable. Il ne faut pas espérer un bon index génomique sur un jeune taureau au mauvais pedigree". Mille veaux issus des meilleures lignées américaines sont génotypés. Les 320 taureaux les mieux indexés sont mis en testage. "Le test génomique est de 250 dollars. Le coût du programme s'accroît légèrement. En contrepartie, nous améliorons le niveau de nos taureaux testés". Un plus pour le centre de sélection qui a l'assurance de sortir de meilleurs taureaux. Un plus pour les éleveurs qui utilisent des semences de taureaux de testage. "Tout le monde y trouve son compte. Et la fiabilité des index est renforcée".


Intervalle de générations


La fiabilité d'un index sur ascendance est de 40%. "Un taureau, indexé à +1500 en production laitière sur ascendance, se situe, en réalité, entre + 1000 et + 2000. L'intervalle de confiance est important". Le génotypage ajoute une information. "La fiabilité s'accroît à 70%. L'intervalle de confiance se réduit à plus ou moins 250". Le testage, tel qu'il est pratiqué aujourd'hui, porte cette fiabilité à 85%. Les résultats des filles de service permettent de connaître la valeur du taureau avec exactitude : 99% de fiabilité. "Sur les critères où les index sur ascendance sont peu fiables, (les fonctionnels), la génomique apporte plus d'information, permettant de passer de 31% à 60% de fiabilité". Sur tous les paramètres, le testage de la descendance apporte des informations supplémentaires par rapport aux tests génomiques. Le risque de perdre du temps dans l'intervalle de générations n'est-il pas trop élevé ? Le programme de sélection de Sélect Sire intègre ce facteur de risque en utilisant quelques jeunes taureaux aux index génomiques exceptionnels, issus des meilleures lignées, comme pères à taureaux. Charlie Will cite, par exemple, le cas d'un fils de Shottle sur Goldwyn, utilisé comme père à taureaux uniquement sur la base de ses index génomiques et dont les fils seront, eux, intégrés au programme de testage.


De nouvelles lignées ?


Select Sires s'engage à fournir les résultats des tests génomiques, qu'ils réalisent, aux éleveurs. "Au vu de ces résultats, certains éleveurs sont tentés de demander un supplément sur le prix de leur animal. D'autres ont peur de tester leurs meilleures lignées au risque de les voir dévaluées par un résultat d'indexation plus faible". La génomique rebat les cartes. Des nouvelles lignées sont découvertes. "C'est assez rare", précise toutefois Charlie Will. "Il m'est cependant arrivé de repérer des vaches exceptionnelles en morphologie, aux index seulement acceptables en production et de les intégrer au programme". Il cite ainsi l'exemple d'une fille de Ito, pointée Ex 94, collectée par son propriétaire, qui, sans faire partie des meilleures laitières indexées aux États-Unis, a placé trois de ses fils dans le programme de Select Sires au vu de leurs résultats d'indexation génomique, excellents dans tous les postes et surtout nettement supérieurs à leurs index sur ascendance.

Bernard Laurent


Légende : Charlie Will, responsable génétique de Select Sires, est intervenu lors d'une réunion d'éleveurs, organisée par la société Bovec, mercredi 11 février à Chartres de Bretagne.


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Date de l'article : semaine du N° du 20 au 26 Février 2009
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